Đình được tạo dựng vào đầu thế kỷ thứ XIX. Ban đầu chỉ là một ngôi miếu nhỏ nằm ở gò cao ruộng ông Bồn, có quy mô và kiến trúc đơn giản, làm bằng vật liệu thô sơ sẵn có ở địa phương: gỗ, tre, lá... Trải qua những biến động lịch sử, ngôi miếu xuống cấp và được trùng tu, sửa nhiều lần. Năm 1820, ngôi miếu chuyển về hướng rừng già cất thành ngôi đình; Năm 1832, ngôi đình lại chuyển về đồi Cây Dầu. Năm 1998 đình Phú Mỹ được sửa chữa mái tiền, chánh điện và xây thêm một số bục bệ thờ.
Đình có kết cấu kiến trúc kiểu chữ Tam ( ) gồm: tiền đình, chánh điện và Nhà khách nối tiếp nhau. Vật liệu làm đình bằng gỗ căm xe, rất bền có tính năng chịu lực cao, là công trình kiến trúc nghệ thuật độc đáo còn bảo lưu được những nét tiêu biểu về kiểu thức của ngôi đình làng Nam bộ.
Theo phong tục đình Phú Mỹ thờ thành hoàng bổn cảnh - vị thần bảo vệ, phù hộ cho làng xã; thờ tiền hiền, hậu hiền - những vị có công khai phá, xây dựng và phát triển làng xã.
Đình Phú Mỹ còn là nơi bí mật gặp gỡ, trao đổi công tác của cán bộ cách mạng ở hai xã Phú Hội, Phú Mỹ trong những năm tháng kháng chiến chống Pháp và Mỹ. Đặc biệt khi nghe tin Bác Hồ mất, nhân dân Phú Hội vô cùng thương tiếc đã rước vong linh Bác vào đình thờ phụng dưới hình thức ba bức hoành phi chữ Hán đúc rút từ kinh thi. Nội dung ca ngợi công đức của vị lãnh tụ vĩ đại của dân tộc:
Hồ nhiên nhi thiên
Chí vọng thâm ân
Minh hoài hậu đức.
Ba từ đầu của ba bức hoành phi ghép lại thành tên Hồ Chí Minh. Đó là trí tuệ sáng tạo độc đáo và khéo léo đến tuyệt vời của người dân nơi đây.
Sau ngày miền Nam giải phóng, Đảng bộ, chính quyền và nhân dân xã Phú Hội đã rước ảnh Bác vào thờ trong đình và năm 2004 Bộ tư lệnh lăng Chủ tịch Hồ Chí Minh hiến cúng bức tượng Bác Hồ bằng đồng được đặt thờ trong Chánh điện.
Hàng năm nhằm ngày 15, 16 tháng 11 (âm lịch), đình tổ chức cúng Thần và dâng hương tưởng nhớ công ơn Bác Hồ, có đông đảo nhân dân địa phương và các vùng lân cận về dự để gửi gấm những tâm tư, tình cảm, ước vọng của mình với Thần linh, với Bác Hồ kính yêu.
Tháng 5-2006, di tích đình Phú Mỹ được tiến hành bảo quản, gia cố bằng nguồn kinh phí của tỉnh Đồng Nai, huyện Nhơn Trạch và xã Phú Hội.
Theo Báo Đồng Nai.