Con trai ông là Phan Huy Ích. Khi còn trẻ vừa đi học vừa đi dạy. Sau khi đỗ Tiến sĩ thì làm quan cho nhà Lê, nhà Tây Sơn. Sau khi nhà Tây Sơn sụp đổ thì ông về Thuỵ Khê (Thạch Thất, Hà Tây) dạy học. Sau đó ông còn đi dạy học ở Thanh Mai, Cổ Nhuế, Thăng Long. Con trai thứ của Phan Huy Cận là Phan Huy Ôn cũng đỗ Tiến sĩ và làm quan nhưng vẫn dành thời gian để soạn sách dạy học. Ông này đặc biệt giỏi về môn toán. Con thứ tư của Phan Huy Cận là Phan Huy Sảng cũng mở trường dạy học ở Cổ Nhuế, Yên Lãng.
Cháu nội ông là Phan Huy Quýnh, Phan Huy Thực, Phan Huy Chú (cả ba là con của Phan Huy Ích) cũng chuyên tâm với nghề thầy giáo. Phan Huy Quýnh học giỏi nhưng không thi mà suốt đời ở nhà dạy học. Phan Huy Thực cũng không đi thi nhưng vua Minh Mạng vẫn mời ông vào triều để dạy lễ nghi. Phan Huy Chú chỉ đỗ tú tài nhưng học trò theo học rất đông, nhân dân tôn ông là kép Thầy. Ông để lại cho đời sau cuốn "Lịch triều hiến chương loại chí" nổi tiếng.
Chắt nội của Phan Huy Cận là Phan Huy Vịnh (con Phan Huy Thực) cũng đã dạy học ở nhà cho đến khi đỗ cử nhân và làm quan. Khi đi làm quan ông cũng vẫn thu nhận học trò.
Cả nhà Phan Huy Cận nối nhau bốn đời làm thầy giáo. Văn chương của họ cũng nổi tiếng đương thời với nhiều thành tựu. Như vậy, đối với sự nghiệp giáo dục, dòng dõi Phan Huy Cận có những đóng góp rất lớn.
Nguyễn Xuân.